潔凈空調(diào)系統(tǒng)應(yīng)按其所生產(chǎn)產(chǎn)品的工藝要求確定，一般不應(yīng)按區(qū)域或簡單的按空氣潔凈度等級劃分。
1、空調(diào)系統(tǒng)劃分的原則如下：
（1）一般空調(diào)系統(tǒng)、兩級過濾的送風(fēng)系統(tǒng)與潔凈空調(diào)系統(tǒng)要分開設(shè)置。
（2）運(yùn)行班次、運(yùn)行規(guī)律或使用時間不同的潔凈空調(diào)系統(tǒng)要分開設(shè)置。
（3）產(chǎn)品生產(chǎn)工藝中某一工序或某一房間散發(fā)的有毒、有害或易燃易爆物質(zhì)可能會對其他工序或房間產(chǎn)生有害影響，或危害人員健康或產(chǎn)生交叉污染時，應(yīng)分別設(shè)置潔凈空調(diào)系統(tǒng)。
（4）溫度、濕度的控制要求或精度要求差別較大的系統(tǒng)宜分開設(shè)置。
（5）潔凈空調(diào)系統(tǒng)的劃分宜照顧送、回風(fēng)和排風(fēng)管道的布置，盡量做到布置合理、使用方便，力求減少各種風(fēng)管管道交叉重疊，必要時，對系統(tǒng)中個別房間可按要求配置溫度、濕度調(diào)節(jié)裝置。
2、潔凈空調(diào)設(shè)計計算的一般步驟
（1）根據(jù)工藝要求確定潔凈室的潔凈度等級，選擇氣流流型，并決定采用全室空氣凈化還是局部空氣凈化。相對來說，非單向流和局部空氣凈化投資較小，應(yīng)盡量避免采用全室空氣凈化。設(shè)置空氣凈化范圍的原則：
a.全室空氣凈化是采用集中凈化空調(diào)系統(tǒng)在整個房間內(nèi)造成具有相同潔凈度環(huán)境的凈化處理方式，這種方式適用于工藝設(shè)備高大，數(shù)量多，且室內(nèi)要求相同潔凈度的場所。全室空氣凈化投資大、運(yùn)行管理復(fù)雜、建設(shè)周期長，因此采用時必須謹(jǐn)慎，應(yīng)盡量避免采用。
b.局部空氣凈化是采用凈化空調(diào)器或局部凈化設(shè)備(如潔凈工作臺、棚式垂直層流單元、層流罩等)，在一般空調(diào)環(huán)境中造成局部區(qū)域具有一定潔凈度環(huán)境的凈化處理方式。這種方式適用于生產(chǎn)批量較小或利用原有廠房進(jìn)行技術(shù)改造的場合。
c.采用全室凈化與局部凈化相結(jié)合的凈化處理方式，既能保證室內(nèi)具有一定潔凈度，又能在局部區(qū)域?qū)崿F(xiàn)高潔凈度環(huán)境，從而達(dá)到滿足生產(chǎn)對高潔凈度環(huán)境的要求和節(jié)約能源的雙重目的。
（2）計算新風(fēng)量，取下列兩項中的大者：
a.補(bǔ)償室內(nèi)排風(fēng)量和保持室內(nèi)正壓值所需新鮮空氣量之和。
b.保證供給潔凈室內(nèi)的新鮮空氣量不小于40M3/(h.人)。
（3）計算潔凈室的冷、熱和濕負(fù)荷。
（4）計算送風(fēng)量，取下列三項中的大值：
a.為保證空氣潔凈度等級的送風(fēng)量。
b.根據(jù)冷熱和濕負(fù)荷計算確定的送風(fēng)量。
c.向潔凈室內(nèi)供給的新風(fēng)量。
（5）根據(jù)送風(fēng)量、冷熱負(fù)荷和選擇的氣流組織形式，計算氣流組織和各參數(shù)。
（6）確定空氣加熱、冷卻、加濕、減濕等處理方案及回風(fēng)方式（一次或二次回風(fēng)）
（7）根據(jù)工藝要求或氣流組織計算時確定的送風(fēng)溫差及室內(nèi)外計算參數(shù)，確定各狀態(tài)點，計算空調(diào)器處理風(fēng)量及潔凈室循環(huán)風(fēng)量。
（8）計算總的冷、熱負(fù)荷，選擇空氣處理設(shè)備。
（9）校核潔凈室內(nèi)的微粒濃度和細(xì)菌濃度。
3、室內(nèi)的溫度和濕度
潔凈室內(nèi)的溫濕度應(yīng)滿足以下要求：
（1）舒適性要求。室內(nèi)的溫濕度要滿足工作人員的舒適性要求。
（2）工藝要求。我國GMP規(guī)定：潔凈室（區(qū)）的溫度和相對濕度應(yīng)與藥品生產(chǎn)工藝要求相適應(yīng)。無特殊要求時，溫度控制在18～26℃為宜。不同的產(chǎn)品、物品以及生產(chǎn)工藝、工序，對生產(chǎn)環(huán)境溫度，濕度的要求各不相同。有的需要恒溫恒濕環(huán)境。